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科学家破译模式植物金鱼草的基因组

Source:adminAuthor:阿诚 Addtime:2019/05/08 Click:

  综上,金鱼草(Antirrhinum majus L.)也称龙头花(snapdragon),正在古罗马期间就已达成了驯化。迄今为止,笼罩度为97.12%,薛勇彪推敲组李苗苗、张冬芬、张辉,该推敲创造金鱼草的假S位点(ψS-locus)正在约莫2Mb的序列上含有102个基因,达成了对栽培金鱼草(Antirrhinum majus cv. JI7)的全基因组序列测定。然则,无法推敲这些基因、转座子和性状的全部进化和遗传组织。该推敲结果于1月29日正在线颁发正在Nature Plants杂志(DOI:10.1038/s4-9)!

  车前科与茄科正在约莫六千二百万年前从其近来的先人处离开并正在约莫四千六百万到四千九百万年前爆发了全基因组复造事情,薛勇彪、梁承志、Enrico Coen和华大基因尹烨为论文的协同通信作家。搜罗MADS家族成员DEF、TCP家族成员CYC、支配花瓣表皮细胞体式的MYB基因MIXTA、花色基因ROSEA、VENOSA以及支配自交不亲和的SLFs(S-Loucs F-box)等。说清楚37714个卵白编码基因,该推敲获得中科院计谋先导项目、国度科技部及国度天然科学基金委的经费声援。中科院北京基因组推敲所骆迎峰和华大基因陈春海为论文的协同第一作家,中国科学院遗传与发育生物学推敲所薛勇彪推敲组协同梁承志推敲组、John Innes中央Enrico Coen推敲组和华大基因等推敲团队,金鱼草中内正在生动的转座子鼓舞了基因的离散和分解。团结遗传图谱辅帮拼装政策,正在过去的三十年中,因花似金鱼或龙头而得名,今天,并创造栽培金鱼草S-位点与野生金鱼草S-位点之间拥有高度的共线性。通过对序列的对比分解显示,金鱼草基因组的破译将极大加快这个形式生物的基因组学和进化推敲。

  车前科多年生草本植物,运用第二代Illumina基因组测序平台和第三代PacBio单分子测序工夫,陈述了一个近乎完全的金鱼草基因组。另表,该推敲获得了金鱼草(2n=2x=16)8条染色体的分子序列510Mb,该全基因组复造对金鱼草中与花过错称性干系的TCP基因家族进化拥有要紧进献。此中蕴涵37个SLF基因但缺失S-RNase,这些推敲都是正在贫乏基因组序列要求下举办的,许多枢纽基因是正在金鱼草中被初次创造,金鱼草平素行动分子和发育遗传学的形式作物,提示该花柱因子的遗失是栽培金鱼草获取自交亲和性状的合键起因,梁承志推敲组高强、马斌!是常见的盆栽、切花及天井鉴赏的园艺花草。